Книжный фонд Национальной библиотеки Республики Саха (Якутия) составляет 1,4 млн томов, жемчужиной которого является фонд редких и ценных документов, включающий в себя первые издания на якутском языке и языках народов Якутии, дореволюционные краеведческие издания, книги из дореволюционных публичных и частных библиотек, свод печатной памяти Республики Саха (Якутия) «Сандалы-Бичик», дарственные коллекции, дореволюционные церковные издания, старинные книги на иностранных языках, миниатюрные книги, рукописи и т. д. В фонде хранятся знаменитый труд академика О.Н. Бетлинга «О языке якутов», первые издания описаний научных экспедиций Ф.П. Врангеля, А.Ф. Миддендорфа, Г. Майделя, научные труды политссыльных И.А. Худякова, В.Л. Серошевского, И. Майнова, П. Драверта. Гордостью библиотеки являются «Памятные книжки Якутской области», «Обзоры Якутской области», «Якутские епархиальные ведомости», «Образцы народной литературы якутов», дореволюционная периодическая печать Якутии и др.