Крафт был инициатором создания в Якутске отдела Русского Географического общества. 1 июля 1907 г. вышла первая демократическая газета «Якутский край» на двух языках: на русском и якутском. Разрешил выпуск журнала на якутском языке. Помог Э.К. Пекарскому с изданием академического словаря «Якутский язык». Содействовал в конце августа 1912 г. созыву съезда якутов, который решил насущные вопросы.
До Крафта Якутск был похож на поселок, мало что напоминал город. С приездом город преобразился. Были открыты два банка, телефонная станция. Построены каменные здания областного суда, казначейства, здание реального училища, здание библиотеки и музея. Добился строительства электростанции, реконструирован речной порт, замощены улицы. Украшением города стал сквер с фонтаном, где были посажены реликтовые кусты и деревья. В праздничные дни здесь проводились мероприятия, где охотно отдыхали горожане. Для них играл губернаторский оркестр. По его ходатайству в 1914 г. была открыта учительская семинария, воспитавшая будущих учителей и политических и общественных деятелей республики.
Решением городской думы от 13 декабря 1913 г. действительному статскому советнику, губернатору Якутской области И. И. Крафту было присвоено звание почетного гражданина города Якутска.
Губернатор И.И. Крафт 22 июля 1913 г., тепло провожаемый якутянами, выехал из Якутска к месту нового назначения в Красноярск. Иван Иванович Крафт оставивший заметный след в общественно-политическом и экономическом развитии Якутии, умер 21 ноября 1914 г. в Петрограде. Благодарные сибиряки его прозвали «маленьким Сперанским».
