Пришедший в Москву сразу в два Наркомата, здравоохранения и обороны, тревожный сигнал вызвал молниеносную реакцию. По приказу Наркомздрава вирусолог Лев Зильбер организовал комплексную экспедицию для изучения загадочной «таёжной болезни» на Дальнем Востоке. Экспедиция включала специалистов из научных и медицинских учреждений г. Москвы и г. Ленинград (Центральной вирусологической лаборатории, Зоологического института Академии наук СССР, Военно-медицинской академии и других). Согласно протокола эпидемиологического совещания при Крайздраве от 11.7.1936 г. всех местные, дальневосточные, материалы по имевшимся вспышкам, должны были быть систематизированы и предоставлены начальнику экспедиции. Подготовка экспедиции началась в феврале 1937 г. 

Было разработано три плана работ: на случай, если заболевание — японский энцефалит, на случай, если заболевание другой энцефалит, на случай — если заболевание — вообще не энцефалит.